设置

菜单中的“设置…”会打开 NeoDownloader 的整体设置：适用于每个项目的设置。项目自己的设置在它的“属性”中，参见项目。

设置窗口

左侧是各个页面，分在“程序”和“扩展”之下，打开“显示全部设置”后还有“协议”；右侧是您选中的页面。设置名称旁边的问号会说明这项设置的作用：把鼠标指向它，或者按 Tab 键移到它上面。

“确定”会一次保存您的全部更改，“取消”则全部放弃。有了更改之后，“确定”才会变为可用。如果您在有未保存更改时点击“取消”或关闭窗口，NeoDownloader 会询问“放弃未保存的更改吗？”，可选“继续编辑”或“放弃”。

无法使用的值会在对应的框旁边标出，它所在的页面也会在列表中标出：“这一页上有需要改的地方”。

显示全部设置

有些设置面向高级用户，在您打开左下角的“显示全部设置”之前一直是隐藏的。含有隐藏设置的页面会在底部注明“另有 … 项面向高级用户的设置”，而“显示它们”会替您打开这个开关。

更改何时生效

“常规”页面上的设置从您点击“确定”的那一刻起就会生效。“下载”、“运行”和“日志”页面上的设置，在项目开始运行时才对它生效：已经在进行的运行会沿用开始时的数值。其中一些设置会在框下方注明“下次运行时生效”。

只有一个例外：调高“同时运行几个项目”后，已经在队列中等待的项目会立即开始。

程序

常规

默认下载文件夹 - 新建项目时默认给出的文件夹；已有的项目保留当初给它们的文件夹。除非您另选，否则就是您的“下载”文件夹中的 NeoDownloader 文件夹。“选择…”会打开“选择文件夹”，其中有“上一级”、“新建文件夹”和“就用这个文件夹”。在便携版中，这个框不能修改：便携版会把文件下载到程序旁边，项目的文件夹可以在新建项目时选择。
保留多少个已删除的项目 - 回收站保存多少个已删除的项目，默认为 50 个。设为 0 时回收站什么都不保留，删除项目就是永久删除。调低的数值在下一次删除时生效。参见回收站。
在线检查许可证 - 获知续期，退款后转为免费版；默认开启。关闭后，NeoDownloader 会继续使用现有的许可证，在许可证窗口中仍可随时手动检查。参见在线检查许可证。
检查更新 - 有新版本发布时通知您；默认开启。参见更新 NeoDownloader。
ffmpeg 的路径，打开“显示全部设置”后可见 - 仅用于生成视频的缩略图。留空则使用 NeoDownloader 自带的 ffmpeg，或这台电脑上已安装的 ffmpeg。如果您填写的路径指向的不是一个能正常运行的程序，视频就不会有缩略图。

下载

同时下载数 - 一个正在运行的项目同时下载多少个文件，默认为 10 个。两个项目同时运行时，各自分别遵守这个数值。站点允许的数量可能更少。
每个文件试几次 - NeoDownloader 在放弃一个文件之前尝试下载它多少次，默认为 5 次。站点明确拒绝的文件（例如返回 HTTP 404）不会再试。Video Downloader 不使用这项设置：一个视频总共尝试三次后就放弃。
两次尝试之间最长等多久 - 以秒为单位，默认为 60。

打开“显示全部设置”后，还有三项设置决定等待时间。每次重新尝试之前，NeoDownloader 等待的时间是“两次尝试之间第一次等多久”（默认 1 秒），每重复过一次尝试就乘一次“等待倍数”（默认为 2），但绝不会超过“两次尝试之间最长等多久”。“等待抖动”会让每次等待稍长或稍短一些（默认值为 0.25 时，最多相差四分之一），以免许多失败的文件在同一时刻一起重试。如果站点自己指定了等待时间，NeoDownloader 就按站点说的时间等待。

运行

同时运行几个项目 - 同时下载多少个项目，默认为 2 个，最多 10 个；其余的项目在队列中等待。项目会一直占着位置，直到它的文件下载完毕，而不仅仅是到插件结束为止。参见下载。
插件不出声等多久，打开“显示全部设置”后可见 - 以秒为单位，默认为 300。插件沉默超过这个时间就会被结束，日志中会记录“插件不出声了，已被结束。等待秒数: …”。

日志

日志条数 - 每个项目的日志保留多少条记录，默认为 20,000 条；更早的记录会在运行开始时删除。参见日志。

扩展

“扩展”下是插件为整个程序保存的设置，最后是“插件”页面。目前只有一个插件有这类设置：Gallery Downloader，在“站点授权”页面上，参见 DeviantArt 的访问授权。“插件”页面的介绍见插件。

语言

语言不在设置窗口中：在菜单的“语言”下选择。窗口会立即切换到所选语言。